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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

宁夏固原统筹资源，提升农村地区救治水平******

　　马桂芳是宁夏回族自治区固原市西吉县偏城乡偏城村村医，从去年12月中旬开始，她带着村里的医生团队走村入户，为村里行动不便、独居等特殊情况的老人送药上门、协助就医。偏城乡卫生院通过综合老年人患基础疾病情况、疫苗接种情况、患病风险程度等因素，建立起分类管理机制，并设立关心关爱台账。

　　“将重点人群落实落细到家庭医生网格，做到每一名老年人都在网格内，都有责任人。”偏城乡卫生院院长康晓明说，卫生院从县上领取防疫健康“暖心包”后，及时发到各村卫生室，并由村医进村入户第一时间送到重点人群手里。

　　近日，宁夏成立自治区农村地区疫情防控工作专班，通过统筹医疗资源准备，加强疫苗接种和重点人群健康管理，强化医务人员、设备、药品和抗原试剂储备，提升医疗救治能力，有序推进农村地区的疫情应对准备和救治工作。

　　目前，宁夏多个县区免费向重点人群发放装有健康宣教材料、体温计、感冒药等物品的“健康防疫包”1万余个。

　　在固原市彭阳县，依托“乡镇党委—村(社区)党支部—网格(村民小组)党小组—党员联系户”四级组织架构，彭阳县集结党员干部1640名，按照“一个村社区建立一个联络群、一个群织起一张互助网”的原则，组建287支暖心配送服务小分队，为村民精准纾困解难。

　　随着《全区加强农村地区新冠肺炎疫情防控和健康服务工作方案》《新冠病毒感染者居家治疗指南》等出台，宁夏以城市医联体和县域医共体为基础，构建起自治区级和市级医院与县(区)、乡村的对口帮扶机制。

　　同时，利用远程诊疗系统和基层人工智能辅助诊疗系统，宁夏建立分级诊疗和转诊衔接网络，形成区、市、县三级医疗服务城乡联动机制。此外，宁夏已选派937名二级以上医疗机构医务人员支援基层，将培训工作延伸至村卫生室，切实提高基层医务人员居家健康监测、药物对症治疗和对高危群众的识别、诊断及处置能力。（人民日报 记者 秦瑞杰）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）